thumb|Pojemniki na segregowane odpady na Politechnice Gdańskiej Często spotkać można układ mieszany, w którym główny podział np. funkcjonalny, uzupełniony jest klasyfikacją procesowąKisiel P.: Wpływ zmian w systemie zarządzania produkcją na systemy transportu wewnętrznego i magazynowania, Kraków, Automatyka, 2011.Krawczyk S. (red.): Logistyka (tom I, II), Warszawa, Difin 2011.. Taką sytuacje mamy w systemach gospodarki odpadami. System ten jako odrębny moduł pełniący część funkcjonalną logistyki w przedsiębiorstwie oraz będący elementem logistyki miejskiej, może zostać pogrupowany według realizowanych procesów: gromadzenia u źródła powstawania zgodnie z ustaloną formą; uporządkowane nieuporządkowane, magazynowania odpadów, transportu pozostałości, procesów odzysku, unieszkodliwiania bądź przekazania innym jednostkom organizacyjnym, składowania.
Każdy z wyżej wymienionych procesów będzie charakteryzował się swoistymi parametrami. Optymalizacji działań w obrębie systemu zagospodarowani odpadów w ogólnej postaci wyglądać będzie podobnie co w przypadku wyboru najkorzystniejszych parametrów dla głównych procesów logistycznych.