W 1781 roku Austriacy skonfiskowali dobra kościelne Klucza Muszyńskiego. W 1848 roku austriackie namiestnictwo reaktywowało samodzielną parochię w Powroźniku. W 1934 roku parochia weszła w skład nowo powstałej Administracji Apostolskiej Łemkowszczyzny. Ostatnim parochem od 1927 roku był o. Paweł Wach. W 1936 roku w parochii było 1055 wiernych. 4 lipca 1947 roku podczas Akcji „Wisła” wysiedlono 451 Łemków na Zachód i Północ Polski.
Na opuszczone miejsca przybyli polscy repatrianci z Kresów Wschodnich i z przeludnionych wiosek okolic Piwnicznej, Łącka, Kamienicy, Limanowej. Cerkiew zaadaptowano na kościół parafialny, a msze święte odprawiali duchowni z Muszyny i Krynicy. 29 grudnia 1951 roku bp Jan Stepa erygował parafię rzymskokatolicką, a cerkiew zaadaptowano na kościół parafialny. W latach 1965–1966 przeprowadzono generalny remont cerkwi, a w latach 1970–2000 renowację ikon i polichromii. W 2013 roku cerkiew została wpisana na Listę Światowego Dziedzictwa UNESCO wraz z innymi drewnianymi cerkwiami w Polsce i na Ukrainie.