Park jest również domem dwóch gatunków torbaczy. Jeden z nich to torbik bambusowy (Dromiciops gliroides) prowadzący częściowo nadrzewny tryb życia. Prowadzona jest dyskusja dlaczego ten południowoamerykański wygląda na ściślej spokrewnionego z torbaczami z Australazji niż z obu Ameryk. Innym torbaczem jest zbójek długonosy (Rhyncholestes raphanurus) z rodziny zbójnikowatych, opisany przez naukę po raz pierwszy w 1923 r.
W parku zaobserwowano około 80 gatunków ptaków, żyjących na stałe, przelotnych i zalatujących. Wśród rezydentów są krytonosowate, z których najłatwiej jest usłyszeć i czasami zobaczyć krytonosa rudogardłego (Scelorchilus rubecula). Innym przedstawicielem tej rodziny jest turko czarnogardły (Pteroptochos tarnii), który jest rarytasem dla miłośników ptaków. Zbrojówka (Merganetta armata) bywa czasem widywana przy wodospadach Petrohué. Jeden gatunek kolibrów, fernandezik chilijski (Sephanoides sephaniodes) jest tutaj powszechny i łatwy do zobaczenia.
Rodzima ichtiofauna w jeziorze Todos los Santos uległa dewastacji wraz z introdukcją kilku gatunków pstrąga i łososia.