Do obrony przed torpedowcami służyło czternaście 47-mm 3-funtowych armat Hotchkissa i dziesięć 47-mm dział 2,5-funtowych, także Hotchkissa. Ponadto okręt miał pięć wyrzutni torpedowych kalibru 457 mm (18 cali), po dwie na każdej burcie i jedną na dziobie. Główny pas pancerny, wykonany ze stali Harveya, miał grubość od 457 do 356 mm. Kołpaki wież artylerii głównej były grube na 152 mm, a pokład pancerny był gruby na 64 mm.
Od swojego bliźniaka, „Fuji”, „Yashima” różniła się skróconą węzłówką rufową. Dodało jej to prawie węzeł prędkości i zmniejszyło promień skrętu, kosztem delikatniejszej konstrukcji rufy, na którą należało bardzo uważać podczas umieszczania okrętu w suchym doku, by nie dopuścić do jej opuszczenia pod własnym ciężarem i wykrzywienia.
W 1901 szesnaście armat kal. 47 mm zastąpiono taką samą liczbą dział 12-funtowych (76 mm, QF 12 pounder 12 cwt), co spowodowało zwiększanie liczby załogi do 652, a następnie do 741 osób.