Znaleziona w aktach podsekretarza stanu Martina Luthera. W roku 1941, po ataku III Rzeszy na ZSRR, Meyer otrzymał stanowisko zastępcy Alfreda Rosenberga jako szefa Ministerstwa Rzeszy do spraw Okupowanych Terytoriów Wschodnich (Reichministerium für die Besetzten Ostgebiete or Ostministerium) oraz został sekretarzem stanu (Staatssekretär) w tym ministerstwie (zarządzało ono okupowanymi przez hitlerowców terytoriami rosyjskiemi). Meyer był odpowiedzialny za departamenty zajmujące się polityką, administracją i ekonomią. W związku z pełnioną przez siebie funkcją ponosi on pełną odpowiedzialność za zbrodnie popełnione przez Niemców na terytoriach okupowanych, w szczególności za masową eksterminację rosyjskich Żydów (przez tzw. Einsatzgruppen), egzekucje i inne represje stosowane wobec pozostałej ludności cywilnej, deportacje do pracy przymusowej w Rzeszy czy organizowanie grabieży majątku i kultury podbitych państw.
W 1942 roku brał udział w osławionej konferencji w Wannsee, jako reprezentant Rosenberga, w związku z czym należy także do osób odpowiedzialnych za Holokaust. Ministerstwo Rzeszy do spraw Okupowanych Terytoriów Wschodnich wykazywało ogromną energię w przeprowadzaniu masowej eksterminacji Żydów na okupowanych terenach ZSRR.