W maju 1988 został trenerem drużyny seniorskiej (jego asystentem został wpierw Franciszek Pajerski, potem grający zawodnik Jan Ryniak), prowadził drużynę w sezonie II ligi 1988/1989. Następnie kierował zespołem Stali także w edycji II ligi 1989/1990, w trakcie której po I rundzie zrezygnował ze stanowiska na początku stycznia 1990.
W wyborach samorządowych w 1990 bez powodzenia kandydował do Rady Miasta Sanoka z listy Stowarzyszenia Trenerów Polskich.
Został właścicielem Przedsiębiorstwa Handlu Zagranicznego i Wewnętrznego „Juro”, a 13 maja 1991 wybrany pierwszym prezesem nowego klubu hokejowego w Sanoku pod nazwą Sanockie Towarzystwo Sportowe. W tym czasie ukończył Szkołę Menedżerów Sportu w Centrum Doskonalenia Kadr Kierowniczych Ministerstwa Przemysłu (DOSKO). Pod jego kierunkiem STS Sanok awansował do I ligi w 1992. Po sezonie I ligi 1992/1993 pod koniec czerwca 1993 J. Rożdżyński złożył rezygnację z funkcji prezesa.
Następnie w latach 90. przebywał w Wielkiej Brytanii, po czym we wrześniu 1997 został pierwszym trenerem Cracovii. Później ponownie zamieszkał w Londynie.