Według pierwotnej wersji regulaminu przewodniczący i jego zastępca wybierani byli we własnym gronie przez członków Komisji. W roku 1967 Komisja przemianowana została na Komisję Odznaki Honorowej m. st. Warszawy „Za Zasługi dla Warszawy”, a przewodniczący i zastępca wyznaczani byli odtąd przez Prezydium RN m. st. WarszawyUchwała nr 88/826 Prezydium Rady Narodowej m. st. Warszawy z dnia 4 kwietnia 1967 w sprawie zatwierdzenia regulaminu Komisji Odznaki Honorowej m. st. Warszawy „Za Zasługi dla Warszawy”; w: Dziennik Urzędowy Rady Narodowej m. st. Warszawy, 1967, nr 5, poz. 26.. W roku 1971 Komisja Odznaczeniowa połączona została ze Stołeczną Komisją Odznaczeń Państwowych (zajmującą się opiniowaniem wniosków o nadanie orderów i odznaczeń państwowych osobom, których miejsce pracy lub zamieszkania leżało w granicach Warszawy) w Stołeczną Komisję Odznaczeń Państwowych i Odznaki Honorowej m. st. Warszawy „Za Zasługi dla Warszawy”Uchwała nr 88/450 Prezydium Rady Narodowej m. st. Warszawy z dnia 5 stycznia 1971 w sprawie powołania Stołecznej Komisji Odznaczeń Państwowych i Odznaki Honorowej m. st. Warszawy „Za Zasługi dla Warszawy”;