Nagrody i nominacje W okresie 1991–1994 otrzymywała stypendium promocyjne od Fundacji Stypendialnej Katolickich Biskupów Niemieckich „Cusanuswerk” w Bonn w celu realizacji przewodu doktorskiego. W 2011 roku otrzymała fundację Ministerstwa Kultury i Dziedzictwa Narodowego oraz została wyróżniona nagrodą naukową rektora Uniwersytetu Szczecińskiego za 565-stronicową monografię o Marii Komornickiej.
Została dwukrotne nominowana do Nagrody Literackiej Nike: w 2012 za zbiór opowiadań Enerdowce i inne ludzie oraz w 2014 za powieść Niebko (finał Nagrody). Finalistka Nagrody Literackiej „Gryfia” 2012 za Enerdowce i inne ludzie.
Za powieść Niebko została w 2013 roku nominowana w Katowicach do Śląskiego Wawrzynu Literackiego oraz otrzymała 2 kwietnia 2016 w Wiedniu Złotą Sowę Polonii w kategorii „Literatura”. Fundacja Współpracy Polsko-Niemieckiej w Berlinie oraz Stowarzyszenie Willa Decjusza w Krakowie przyznały jej granty w celu realizacji projektów naukowych. W 2017 nominowana do Nagrody Literackiej m.st. Warszawy za powieść Inna od siebie.
Brygida Helbig otrzymała w 2025 Stypendium Literackie Miasta Szczecina przyznane przez Niemieckie Forum Kultury Europy Środkowej i Wschodniej w Poczdamie.