Do startu w fazie grupowej Ligi Europy UEFA 2015/2016 uprawnione były 48 drużyn (w tym 22 zwycięzców rundy play-off, 10 przegranych z rundy play-off Ligi Mistrzów oraz 16 klubów, które otrzymało automatyczną kwalifikację dzięki wygranej w krajowym pucharze lub wysokiej pozycji w ligowej tabeli). Losowanie odbyło się 28 sierpnia 2015 roku w Monako (godz. 13:00). W jego trakcie zespoły zostały rozdzielone na 4 koszyki, następnie rozlosowane i podzielone na 12 grup po 4 drużyny każda. Do jednej grupy nie mogły trafić drużyny z tego samego koszyka i federacji oraz – ze względu na trudną sytuację polityczną – zespoły z Rosji i Ukrainy.
Wszystkie zespoły zagrały ze sobą dwukrotnie w systemie mecz-rewanż. Po 2 najlepsze drużyny z każdej grupy awansowały do 1/16 finału Ligi Europy UEFA.
Podział na koszyki Drużyny zostały podzielone na koszyki na podstawie współczynnika UEFA na rok 2015. Począwszy od tego sezonu zwycięzca ubiegłej edycji Ligi Europy nie bierze automatycznie udziału w fazie grupowej tych rozgrywek.
Kolory w tabeliZwycięzcy grup i zespoły z drugiego miejsca awansujący do 1/16 finału