31 grudnia 1995 r. Oddział ten został zlikwidowany, a w styczniu 1996 r. wojewoda kaliski powołał w to miejsce samodzielną placówkę jako Muzeum Zespół Pałacowo-Parkowy w DobrzycyR. Kąsinowska, op. cit., s. 232.. Podczas reformy administracyjnej wprowadzonej w 1999 r., dawne województwo kaliskie weszło w skład nowo utworzonego województwa wielkopolskiego, a Muzeum znalazło się w gestii starostwa pleszewskiego. 2 lipca 2002 r. placówka dobrzycka – na mocy porozumienia zawartego między samorządami – przekazana została Sejmikowi Województwa WielkopolskiegoI. Krawiec, Nowy gospodarz w dobrzyckim muzeum, [w:] Notatki Dobrzyckie, nr 24, listopad 2002, s. 62-63.. W 2009 r. Muzeum zmieniło profil swojej działalności, przyjmując nazwę: Muzeum Ziemiaństwa w Dobrzycy Zespół Pałacowo-Parkowy. W latach 2018–2020 oddziałem Muzeum Ziemiaństwa w Dobrzycy było – poświęcone osobie Jana Henryka Dąbrowskiego – Muzeum w Winnej Górze (powiat średzki).