WNV znaleziono w Meksyku na farmie krokodyli w Ciudad del Carmen.
Skóra krokodyli, zwłaszcza pokrywająca spodnią stronę ciała, posiada wartość komercyjną, wobec czego choroby dotyczące skóry wymagają skrupulatnego i skutecznego leczenia.
Choroby krokodyli różnią się w zależności od gatunki. Na pewnych farmach częsta jest salmonelloza, nabywana wraz z zainfestowanym pożywieniem, może ona rozprzestrzeniać się dzięki zaniedbaniom higienicznym. Chlamydie (zwłaszcza Chlamydophila psittaci) mogą przetrwać całe lata, jeśli się ich nie leczy, na przykład tetracykliną. Krokodyle mogą też nabyć prątki z zainfestowanego mięsa
Choroby nękające krokodyle obejmują infekcję wywoływaną przez Parapoxvirus, zwaną po angielsku crocodile pox, dotykającą osobników po wylęgnięciu się i młodocianych. Brązowy osad pojawia się wokół oczu, w jamie ustnej, na ogonie. Caiman pox w podobny sposób powoduje zmiany barwy białej, dotykające również okolic oczu, jamy ustnej i ogona. Adenowirusowe zapalenie wątroby wywołuje zapalenie stanów oraz płuc do wieku trzech lat. Zainfekowane zwierzęta mają opuchnięte szczękę i żuchwę, nie mogą nimi poruszać.