Skutki uboczne Ponieważ bimatoprost jest lekiem, daje skutki uboczne (podobnie jak inne substancje lecznicze). Może powodować przekrwienie spojówek, świąd, stany zapalne rogówki i spojówki, uczucie pieczenia i podrażnienia oczu, łzawienie, efekt zamglonego widzenia, ból oka i głowy, wzmożoną pigmentację tęczówki oraz skóry wokół oczodołu. Bimatoprost praktycznie nie wchłania się po zaaplikowaniu na skórę, w związku z czym nie wykazuje ogólnoustrojowych efektów ubocznych, nie wpływa istotnie na ciśnienie tętnicze oraz na rytm pracy serca oraz nie wywołuje interakcji z innymi lekami. Preparatu nie należy stosować w czasie ciąży, jeśli nie jest to wyraźnie konieczne. Zaleca się, aby nie stosować preparatu u matek karmiących piersią.
Poza typowo okulistycznymi działaniami niepożądanymi leki na jaskrę zawierające bimatoprost dają jako skutek uboczny również nadmierny wzrost i ściemnienie rzęs. To zjawisko zostało szybko zauważone przez przemysł kosmetyczny, bo jest to efekt pożądany przez kobiety. Stosowanie leków jest obarczone większym ryzykiem uszkodzenia narządu wzroku u osób, które nie borykają się z problemem nadciśnienia ocznego, ze względu na większe stężenie bimatoprostu.