Stan przejściowy obejmuje tetraedrtyczny atom węgla.
Do reakcji włącza się następnie kolejna reszta asparaginianu. Działa ona jako kwas, oddając kation wodoru na azot – grupie aminowej powstającej w wyniku hydrolizy wiązania peptydowego. Takim sposobem produkt pośredni reakcji rozpada się, powstają produkty.
Istnieje też odrębny pogląd na reakcję katalizowaną przez proteinazę HIV-1, zaprezentowany przez Jaskólskiego i współpracowników. Widzi on rzeczoną reakcję jako proces jednoetapowy, inaczej niż w opisanym wyżej mechanizmie. Występuje w nim cząsteczka wody o właściwościach nukleofilowych, atakująca wiązanie peptydowe wraz z kationem wodoru, oba te zdarzenia rozgrywają się w tym samym czasie.
Przypisy
Bibliografia
Kategoria:Enzymy