Uzyskano różne struktury krystaliczne fotoukładu II. Podjednostki białka (tylko te z rozpoznaną funkcją)PodjednostkaFunkcja D1Białko centrum reakcji, wiąże się z chlorofilem p680, feofityna, β-karoten, centrum chinonowe i manganoweD2Białko centrum reakcjiCP43Wiąże się z centrum manganowymCP47PsbOBiałko stabilizujące mangan Koenzymy/KofaktoryCząsteczkaFunkcjaChlorofilAbsorbuje energię świetlną i przekształca ją na energię chemicznąβ-karotentłumi nadmiar energii fotoekscytacjiHem b559Protoporfiryna IX również zawiera żelazoFeofitynaWstępny akceptor elektronówPlastochinonPrzenosi elektrony w błonie tylakoiduCentrum manganoweCentrum aktywne kompleksu rozkładającego wodę (OEC, z )
Kompleks rozkładający wodę (OEC) thumb|200x200px|Zaproponowana struktura centrum manganowego