Od 2014 nadleśnictwo funkcjonuje w ramach jednego obrębu.
Leśnictwa W skład nadleśnictwa wchodzi trzynaście leśnictw: Marwice Wysoka
Tarnów Mosina Łąkomin Zacisze Łupowo Motylewo Nowiny Białcz Ustronie Witnica oraz szkółka leśna w Sosnach.
Fizjografia i klimat Położenie Lasy Nadleśnictwa Bogdaniec zgodnie z regionalizacją przyrodniczo-leśną położone są w: I Krainie Bałtyckiej, 3 Dzielnicy Wałecko–Myśliborskiej, Mezoregionie Równiny Gorzowskiej; III Krainie Wielkopolsko–Pomorskiej, .
Według regionalizacji fizyczno-geograficznej obszar nadleśnictwa położony jest w: Podprowincji – Pojezierza Południowobałtyckiego (314); Makroregionie – Pojezierza Południowopomorskiego (314.6); Mezoregionie – Równiny Gorzowskiej (314.61); Makroregionie – Pradoliny Toruńsko-Eberswaldzkiej (315.3); Mezoregionie – Kotliny Gorzowskiej (315.33);
Przeważająca część nadleśnictwa leży w I Krainie Bałtyckiej.