Od ukończenia studiów zawodowo związany z Wydziałem Ekonomiki Transportu (przekształconym później w Wydział Ekonomiczny) UG, a od 1994 z Wydziałem Zarządzania tej uczelni. W 2011 objął stanowisko profesora nadzwyczajnego Uniwersytetu Gdańskiego. Był kierownikiem Katedry Finansów i Ryzyka Finansowego na Wydziale Zarządzania UG. Pracował również w Wyższej Szkole Zarządzania w Słupsku oraz w Katedrze Bankowości na Wydziale Finansów i Zarządzania Wyższej Szkoły Bankowej w Gdańsku. Obejmował funkcje skarbnika i sekretarza Gdańskiego Towarzystwa Naukowego.
Pochowany na Cmentarzu Łostowickim w Gdańsku.
Kontrowersje 25 lutego 2020 Komisja ds. Etyki w Nauce PAN ogłosiła, że w jej opinii zachodzi możliwość naruszenia przez Jerzego Gwizdałę praw autorskich i pokrewnych, gdyż w treści jego artykułu „Metoda szacowania VaR w zarządzaniu ryzykiem banku” z 2011 można znaleźć zapożyczenia całych zdań i akapitów z pracy Katarzyny Kuziak pt. „Koncepcja wartości zagrożonej VaR (Value at Risk)”, opublikowanej w 2003 na stronie firmy StatSoft Polska.