Marek Daniel Kowalski (ur. 1966) – polski historyk, mediewista, profesor Instytutu Historii PAN.
Życiorys Absolwent historii Uniwersytetu Jagiellońskiego. Doktorat w 1999 (Uposażenie krakowskiej kapituły katedralnej w średniowieczu; promotor: Jerzy Wyrozumski) i habilitacja w 2011 (Proventus Camerae Apostolicae debiti. Opłaty duchowieństwa polskiego na rzecz papiestwa w latach 1417-1484) tamże. Pracownik Zakładu Historii Polski Średniowiecznej Instytutu Historii UJ. Profesor Instytutu Historii PAN (Zakład Badań Źródłoznawczych i Edytorstwa). Od 2012 członek redakcji czasopisma „Studia Źródłoznawcze”.
Wybrane publikacje Prałaci i kanonicy krakowskiej kapituły katedralnej od pontyfikatu biskupa Nankera do śmierci biskupa Zawiszy z Kurozwęk (1320–1382), Kraków: Towarzystwo Miłośników Historii i Zabytków Krakowa 1996. Kronika Jana z Czarnkowa, tł. z łac. Józef Żerbiłło-Łabuński, oprac. tekstu i przypisów Marek Daniel Kowalski, Kraków: Towarzystwo Autorów i Wydawców Prac Naukowych "Universitas" 1996 (wyd. 2 – 2001, wyd. 3 – 2006, wyd. 4 – 2009). Uposażenie krakowskiej kapituły katedralnej w średniowieczu, Kraków: Towarzystwo Naukowe "Societas Vistulana" 2000. Akta Kamery Apostolskiej, vol.