Fortyfikacje przestały być używane do celu, w którym zostały zbudowane, pomiędzy końcowymi latami XIX w. a początkiem XX w. Niektóre ich części, jak fort Saint Elmo, fort Lascaris oraz Saluting Battery pozostały w użyciu aż do okresu po II wojnie światowej. Fort Saint Elmo został wycofany z użycia w roku 1972. Fortyfikacje zostały wpisane na Listę Zabytków 1925.
W latach 1960. XIX-wieczna Porta Reale została zburzona, dając miejsce nowej City Gate.
Czasy współczesne thumb|left|Odnawianie St. Peter and St. Paul Counterguard (przeciwstraż) w 2013
Pierwsze plany odnowienia fortyfikacji Valletty, równolegle z fortyfikacjami Birgu, Mdiny oraz Cittadelli, zostały zrobione w roku 2006. Prace rozpoczęły się w roku 2010, na podstawie projektu opisywanego jako „największy w stuleciu”. „Dzicy lokatorzy” zostali usunięci z publicznych terenów wokół fortyfikacji. Górna część fortu St. Elmo została odnowiona, jego dolne części – wyczyszczone. Kaplica św. Rocha w St.