Anna Ewa Karnkowska (Anna Karnkowska-Ishikawa) – polska biolożka. Adiunkt na Wydziale Biologii Uniwersytetu Warszawskiego.
Jej zainteresowania badawcze obejmują przede wszystkim taksonomię i filogenezę pierwotniaków.
Życiorys Kariera naukowa Absolwentka Wydziału Biologii Uniwersytetu Warszawskiego, gdzie w 2004 roku napisała pracę licencjacką „Badania morfologiczne grupy krytycznej Euglena spirogyra”, a w 2006 obroniła pracę magisterską „Filogeneza i taksonomia wybranych gatunków z rodzaju Euglena Ehrenberg (Euglenaceae)”. Na wydziale tym podjęła studia doktoranckie zakończone w 2011 roku obroną pracy „Filogeneza i taksonomia autotroficznych euglenin (Euglenea) na podstawie danych morfologicznych i molekularnych”. Wówczas została adiunktem w Zakładzie Systematyki i Geografii Roślin Instytutu Botaniki UW, przekształconym później w Zakład Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji. Jednocześnie od 2013 roku przebywała na kolejnych stażach podoktorskich, początkowo na Uniwersytecie Karola, a następnie na University of British Columbia.