W trakcie kierowania przez niego resortem transportu w Turcji przeprowadzono liczne inwestycje infrastrukturalne, w tym dotyczące rozwoju kolei dużych prędkości, rozbudowy komunikacji publicznej w miastach, tworzenia nowych linii metra, budowy tunelu kolejowego Marmaray pod cieśniną Bosfor oraz przygotowań do budowy Kanału Stambulskiego. Jego projekty z uwagi na znaczny wpływ na środowisko były krytykowane przez część opozycji i ekologów. Krytykowali go również zwolennicy państwa świeckiego, zwłaszcza po ujawnieniu zdjęcia jego żony, która w czasie spotkania męża z przedsiębiorcami, spożywała posiłek w oddaleniu od grupy gości, a głowę miała ściśle zakrytą hidżabem. W późniejszym czasie pojawiały się zarzuty dotyczące nieprawidłowości przy przetargach czy odnoszące się do bogacenia się ministra. Ostatecznie w grudniu 2013 Binali Yıldırım odszedł z rządu.