W ramach integracji użytkownikom platformy SEKAP zostały udostępnione trzy istotne funkcje: Mechanizm pojedynczego logowania (single sign-on), który umożliwia stosowanie tego samego konta ePUAP do logowania się do skrytki na platformie ePUAP oraz do skrzynki kontaktowej na platformie SEKAP. Mechanizm podpisywania dokumentu za pomocą profilu zaufanego, oprócz już dwóch istniejących funkcji: podpisu elektronicznego weryfikowanego certyfikatem kwalifikowanym lub niekwalifikowanego CC SEKAP. Integrację części katalogu usług ePUAP i SEKAP, mieszkaniec który ma zamiar złożyć wniosek elektroniczny, poprzez platformę ePUAP do gminy/miasta w województwie śląskim, zostanie przekierowany na platformę regionalną SEKAP.
Integracje z systemami dziedzinowymi W ramach integracji systemów dziedzinowych, użytkownikom platformy Sekap została udostępniona możliwość elektronicznego przesyłania dokumentów wygenerowanych z dwóch systemów dziedzinowych: Z aplikacji Ekopłatnik, za pomocą której podmiot korzystający ze środowiska, może nieodpłatnie sporządzić wykaz zawierający informacje i dane o zakresie korzystania ze środowiska oraz o wysokości należnych opłat. Wygenerowane zestawienie przesłać za pośrednictwem platformy SEKAP od Urzędu Marszałkowskiego Województwa Śląskiego.