W marcu 2016 wzięła udział w zawodach Austrian Open, gdzie wygrała brązowy medal w wieloboju drużynowym i zajęła 4. miejsce w wieloboju indywidualnym. W tym samym miesiącu Polki zajęły 4. miejsce na zawodach drużynowych Pucharu świata w Stuttgarcie. Jurkowska uplasowała się na 2. miejscu w skoku, 5. na poręczach, 6. na równoważni i 8. w ćwiczeniach wolnych.
W kwietniu zdobyła złoty medal na równoważni i srebro w ćwiczeniach wolnych na Pucharze świata w Chociebużu, po czym zyskała kwalifikację na Igrzyska Olimpijskie w Rio de Janeiro.
Na Mistrzostwach Polski w Zabrzu Jurkowska zdobyła swój drugi tytuł mistrzyni Polski w wieloboju i wygrała złote medale na równoważni i ćwiczeniach wolnych, srebro w skoku i brąz na poręczach. Na Pucharze świata w Warnie, wygrała brązowy medal w skoku i zajęła 5. miejsce na równoważni i 9. na poręczach.
W czerwcu, wzięła udział w Mistrzostwach Europy w Bernie. W kwalifikacjach zajęła 11. miejsce w wieloboju indywidualnym i drużynowym oraz zajęła 15. miejsce na równoważni, 19. w ćwiczeniach wolnych i 54. na poręczach. Zakwalifikowała się do finału w skoku, w którym po upadku zajęła 8. miejsce.