Faza grupowa W fazie grupowej uczestniczą 28 drużyny, które zostały podzielone na 2 grupy po 8 zespołów i na 2 grupy po 6 zespołów. W grupach A i B najlepsze drużyny awansują do ćwierćfinałów, zaś zespoły z miejsc 2-6 powalczą o awans w barażach do ćwierćfinałów. W grupach C i D po dwa najlepsze zespoły zagrają w kwalifikacjach do baraży do ćwierćfinałów.
Losowanie fazy grupowej odbyło się w Glostrup, w Danii 1 lipca 2016 o godz. 13:00. Zespoły były losowane z ośmiu koszyków (grupy A i B) oraz sześciu (C i D). Drużyny z tego samego koszyka, nie mogły trafić do tej samej grupy, z wyjątkiem niemieckich klubów.
Koszyk 1Koszyk 2Koszyk 3Koszyk 4 MVM Veszprém KC Rhein-Neckar Löwen FC Barcelona Vive Tauron Kielce Paris SG Handball RK Wardar Skopje RK Zagrzeb Bjerringbro-SilkeborgKoszyk 5Koszyk 6Koszyk 7Koszyk 8 HC Meszkow Brześć Orlen Wisła Płock MOL-Pick Szeged SG Flensburg-Handewitt Celje Pivovarna Laško Kadetten Schaffhausen IFK Kristianstad THW Kiel
Koszyk 1Koszyk 2Koszyk 3 Naturhouse La Rioja HBC Nantes RK Metalurg Skopje Team Tvis Holstebro HK Motor Zaporoże Czechowskije MiedwiediKoszyk 4Koszyk 5Koszyk 6 Beşiktaş JK Montpellier Handball Dinamo Bukareszt Elverum Håndball Tatran Preszów ABC/UMinho
Awans do ćwierćfinałuAwans do 1/6 finałuAwans do play-offOdpadnięcie z turnieju
Grupa A
Grupa B
Grupa C
Grupa D