Od początku swego funkcjonowania Ośrodek współpracuje z różnymi instytucjami naukowymi w kraju i za granicą, w tym zwłaszcza w ramach Międzynarodowej Komisji Porównawczej Kościołów, pod której auspicjami zorganizował kilka konferencji o charakterze międzynarodowym. Do cyklicznych imprez naukowych organizowanych przez Ośrodek należy coroczna ogólnopolska konferencja naukowa historyków zakonnych – sióstr historyczek i archiwistek. Ostatnia, 50. jubileuszowa ogólnopolska konferencja zatytułowana „Błogosławiony Stefan Kardynał Wyszyński Prymas Polski. Ojciec żeńskich wspólnot zakonnych” odbyła się w Warszawie w dniu 16 października 2021 roku.
Dyrektorzy 1956–2001: Jerzy Kłoczowski 2001–2018: Henryk Gapski 2018–2022: Agata Mirek od 2022: Bogumił Szady
Projekty badawcze (Archi)diecezja lubelska 1805–2005 (kierownik Henryk Gapski) Organizacja parafialna Kościoła łacińskiego w Polsce średniowiecznej i w Rzeczypospolitej Obojga Narodów (X-XVIII w.) (kier. Jerzy Kłoczowski) Zakony męskie i żeńskie w Polsce średniowiecznej i w Rzeczypospolitej Obojga Narodów (X-XVIII w.) (kier. Jerzy Kłoczowski) Działalność żeńskiego ruchu zakonnego w warunkach państwa totalitarnego w latach 1945–1989 (kier. s. Agata Mirek) Dokument w działalności arcybiskupów gnieźnieńskich do końca XIV w. (kier.