Życie z Aborygenami thumb|left|Daisy Bates z grupą aborygeńskich kobiet ok. 1911 Powróciła do Australii w 1899. Po artykułach w The Times o złym traktowaniu Aborygenów zaproponowała gazecie zbadanie sprawy. Oferta została przyjęta. Pierwszy kontakt z Aborygenami miała w Beagle Bay niedaleko Broome. Zaczęła tworzenie słowników i mogła zobaczyć tajne rytuały. W 1904 została zatrudniona przez rząd Australii Zachodniej do badania lokalnych plemion. Badała i opisywała języki, mity, religię i relacje rodzinne.
W 1910-1911 towarzyszyła profesorowi Alfredowi Radcliffe-Brownowi w ekspedycji etnologicznej mające na celu zbadanie zwyczajów ślubnych w Australii Zachodniej. Została mianowana Obrońcą Aborygenów. W 1912 stworzyła pierwszy obóz na pustyni Nullarbor, na której spędziła 16 lat.
W 1934 odznaczona Komandorią Orderu Imperium Brytyjskiego (CBE).
Zaprzyjaźniła się z dziennikarką Ernestine Hill, która pomogła jej powrócić do Adelaide w 1935 i wydać autobiografię. Opracowała również swoją dokumentację i przekazała 99 skrzyń do Biblioteki Narodowej Australii.