Pochodzenie Kallawaja nie jest do końca poznane, sami Kallawaya uważają się za potomków dawnej cywilizacji Tiwanaku.

Kallawaja, wędrując przez Andy, mają styczność z wieloma grupami językowymi i są wielojęzyczni. Posługują się językami keczua, ajmara i hiszpańskim. Dla celów praktyki medycznej rozwinęli własny tajny język mieszany – kallawaja, bazujący głównie na wymarłym języku pukina. Językiem kallawaja posługuje się ok. 100–200 osób, przez co język ten uznawany jest za zagrożony wymarciem.

Kallawaja mieli być lekarzami wyższych klas Inków. Popyt na praktyki medyczne Kallawaja był szczególnie duży na początku XX wieku, kiedy to uznano, że Kallawaja wyleczył córkę prezydenta Peru Augusta B. Leguíi y Salcedo (1863–1932), którą medycyna zachodnia uznała za śmiertelnie i nieuleczalnie chorą.

Medycyna tradycyjna thumb|300px|Prośba Kallawaja do sił natury o przychylność, ceremonia na Wyspie Słońca, na jeziorze Titicaca