W tym samym roku, gdy an-Numajri został obalony podczas kolejnego zamachu stanu, Hasan at-Turabi stanął na czele nowej organizacji fundamentalistycznej – Islamskiego Frontu Narodowego. Miała ona walczyć o państwo muzułmańskie, którego kształt nakreślił at-Turabi w pracach teoretycznych. Zaznaczał, że nie będzie to państwo świeckie, lecz kraj, w którym w życiu publicznym dominuje islam; państwo, w którym ważniejsza jest pobożność obywateli niż lojalność wobec narodu; państwo podlegające normom szari'atu. At-Turabi podkreślał, że obywatelom należy pozostawić szeroki zakres swobody, a tam, gdzie społeczeństwo jest w stanie samo się regulować i rozwiązywać problemy interwencja państwa jest zbędna. Zaznaczał, że każdy człowiek ma prawo do edukacji, ochrony godności, prawo do życia i do życia w pokoju. Islamski Front Narodowy stawiał sobie za cel zaprowadzenie rządów szari'ackich nie tylko w Sudanie, ale w całej Afryce wschodniejK. Izak, Leksykon..., s. 86.. W maju 1988 roku został ministrem sprawiedliwości, a rok później ministrem spraw zagranicznych Sudanu.