Aby doszło do starcia gracze muszą znajdować się blisko siebie i zeskanować swoje unikalne kody QR, jednak osoby o wysokim wskaźniku przyjaźni mogą walczyć ze sobą z dowolnego miejsca na świecie. Do dyspozycji graczy oddano trzy różne ligi (Great League, Ultra League i Master League), podzielone pod względem wartości siły bojowej pokémonów w nich walczących. Za odniesione zwycięstwa gracze otrzymują nagrody, m.in. cenne przedmioty potrzebne do ewolucji swoich podopiecznych. Pod koniec lipca 2019 do gry wprowadzono Team GO Rocket – grupę antagonistycznych postaci niezależnych, przejmujących Pokéstopy i posługujących się w walce Shadow Pokémonami, czyli zniewolonymi mrocznymi wersjami zwykłych Pokémonów. Odwiedzając Pokéstop przejęty przez Team GO Rocket, gracz może stoczyć walkę z członkiem grupy, a w przypadku wygranej schwytać porzuconego przez niego Shadow Pokémona. Te można następnie poddać oczyszczeniu (ang. purification), zwiększając ich wartość bojową. Na początku listopada 2019 w grze odbył się pierwszy płatny event dostępny dla graczy na całym świecie, zatytułowany „A Colossal Discovery”. Nagrodami dla uczestników wydarzenia były m.in.