Od 2018 była zawodniczką grupy MAT Atom DeweloperJustyna Kaczkowska w MAT Atom Deweloper

Pierwszy sukces międzynarodowy odniosła w 2014, zdobywając w wyścigu drużynowym na dochodzenie wicemistrzostwo Europy Juniorów (z Natalią Radzicką, Nikol Płosaj i Darią Pikulik. W 2015 została mistrzynią świata juniorek i mistrzynią Europy juniorek w wyścigu indywidualnym na dochodzenie. Ponadto zdobyła też srebrny medal mistrzostw świata juniorek w scratchu i srebrny medal mistrzostw Europy juniorek w wyścigu drużynowym na dochodzenie (z Darią Pikulik, Nikolą Różyńska i Weroniką Humelt). W 2016 rozpoczęła starty seniorskie. Na mistrzostwach świata zajęła 7. miejsce w wyścigu drużynowym na dochodzenie, podczas igrzysk olimpijskich w Rio de Janeiro w tej samej konkurencji zajęła 8. miejsce, a na mistrzostwach Europy zdobyła srebrne medale zarówno w wyścigu indywidualnym na dochodzenie, jak i wyścigu drużynowym na dochodzenie (z Nikol Płosaj, Darią Pikulik, Łucją Pietrzak i Katarzyną Pawłowską). Również w 2016 została ponadto młodzieżową mistrzynią Europy w wyścigu indywidualnym na dochodzenie, a w wyścigu drużynowym na dochodzenie zdobyła brązowy medal (z Łucją Pietrzak, Moniką Graczewską i Darią PikulikWyniki Justyny Kaczkowskiej na stronie the-sports.org.