Początkowo ekspedycja składała się tylko z trzech kosmonautów. Kolejna trójka dołączyła do załogi 19 marca 2016 roku, gdy na stację na pokładzie Sojuza TMA-20M przybyli Rosjanie: Aleksiej Owczynin i Oleg Skripoczka oraz Amerykanin Jeffrey Williams. Oleg Skripoczka był wcześniej członkiem ekspedycji 25 i 26. Z kolei dla Jeffreya Williamsa była to 4 wizyta na ISS. Wcześniej odbył on lot promem kosmicznym Atlantis w ramach misji STS-101, a także był członkiem 13, 21 i 22 (jako dowódca) stałej załogi ISS.
Ekspedycja 47 zakończyła się, gdy początkowa trójka członków załogi rozpoczęła lot powrotny na Ziemię 18 czerwca 2016 roku. Aleksiej Owczynin, Oleg Skripoczka i Jeffrey Williams pozostali na Międzynarodowej Stacji Kosmicznej, jednak przeszli do składu 48 stałej załogi, gdzie Amerykanin został dowódcą stacji.
Załogę rezerwową stanowiły odpowiednie załogi rezerwowe Sojuza TMA-19M i Sojuza TMA-20M.