Rozwój filogenetyki molekularnej sprawia, że dotychczasowa systematyka oparta głównie na morfologii i anatomii jest podważana. Według tych badań rodzaj Lemanea należy do kladu obejmującego m.in. przedstawicieli rodzajów Batrachospermum, Nothocladus, Paralemanea, Petrohua, Psilosiphon, Sirodotia i Tuomeya. Wymagałoby to uznania, że rodziny takie jak Lemaneaceae powinny być utożsamione z rodziną Batrachospermaceae, co uczyniłoby rząd Batrachospermales monotypowym.
W zależności od ujęcia systematycznego wyróżnia się w obrębie rodzaju od kilkunastu do kilkudziesięciu gatunków. W systemie serwisu AlgaeBase oprócz wyżej wymienionych jako zweryfikowane latem 2016 r. określono następujące gatunki (pozostałe występujące w publikacjach są albo uznane za synonimy innych lub jeszcze niezweryfikowane): Lemanea borealis Atkinson Lemanea ciliata (Sirodot) De Toni Lemanea condensata Israelson Lemanea crassa S.L.Xie & Z.X.Shi Lemanea deamii J.L.Blum Lemanea fluviatilis (Linnaeus) C.Agardh Lemanea fucina Bory Lemanea fucina var.