Fauna Nad jeziorami stwierdzono występowanie ok. 80 gatunków ptaków, z których 24 są endemiczne. Należą do nich gołąbeczek szarawy (Columbina buckleyi), wróbliczka zielonolica (Forpus coelestis) oraz garncarz jasnonogi (Furnarius leucopus). Ponadto, na obszarze tym żyją między innymi: fregaty wielkie (Fregata magnificens), długoszpony krasnoczelne (Jacana jacana), czarnobłyski peruwiańskie (Dives warczewiczi), czakalaki rudogłowe (Ortalis erythroptera) i zagrożone wyginięciem stadniczki siwolice (Brotogeris pyrrhoptera).
W wodach La Tembladery występuje 21 gatunków ryb, w tym tilapia mozambijska (Oreochromis mossambicus) i akara pomarańczowopłetwa (Andinoacara rivulatus). W jeziorach żyją też rakowce z gatunku Cherax quadricarinatus, kajmany okularowe (Caiman crocodilus) oraz żółwie z rodziny skorpuchowatych (Chelydridae). W okolicach jezior stwierdzono także występowanie 20 gatunków ssaków.