Masakrę przerwała dopiero ucieczka strażników, spowodowana nalotem niemieckiego lotnictwa. Według wspomnianego świadka ocalało dzięki temu około 80 więźniów. Z kolei według raportów NKWD z więzienia uciekło 107 więźniów. Informują one ponadto, że 94 pensjonariuszy wywieziono do więzienia w Tarnopolu. Ostatecznie do Wierchnieuralska na południowym Uralu dotrzeć miało 65 więźniów z Brzeżan.
Źródła podają rozbieżne informacje na temat liczby zamordowanych. W raportach NKWD zapisano, że „ubyło według pierwszej kategorii” 174 więźniów. Polskie źródła szacują natomiast, że ofiarą masakry padło od ponad 200 do ponad 300 osób.
Epilog Masakra więzienna nie była jedną zbrodnią popełnioną przez Sowietów w Brzeżanach w lecie 1941 roku. Nieustalona liczba mieszkańców padła bowiem ofiarą wycofujących się na wschód czerwonoarmistów. Żołnierze wrzucali granaty do piwnic, w których ukrywali się cywile, a także z niejasnych powodów wzięli zakładników spośród miejscowej ludności – w tym kobiety i dzieci – których później zamordowali przy drodze Brzeżany–Szybalin.