Sanktuarium San Francesco da Paola (pol. sanktuarium św. Franciszka z Paoli) – rzymskokatolicki kościół w Genui w dzielnicy San Teodoro. Jest położony na terenie parafii San Rocco Sopra Principe.
Nosi wezwanie św. Franciszka z Paoli, patrona ludzi morza. W 1930 roku podniesiony do godności bazyliki mniejszej.
Historia Początki kościoła związane są ze Franciszkiem z Paoli, który podczas podróży do Francji na zaproszenie króla Ludwika XII, przejeżdżał przez Genuę goszcząc u księcia Dorii. Gdy zobaczył wzgórze, na którym obecnie wznosi się sanktuarium, przepowiedział zbudowanie na nim kościoła pod wezwaniem Jezusa i Maryi. Według zachowanego aktu notarialnego z 22 października 1478 roku Ludovico Centurione zakupił z rąk Martina della Chiavica jego posiadłość i przekazał braciom minimitom. Jednak pierwotny kościół nie zachował się. Obecny zawdzięcza swoje powstanie fundacjom rodów genueńskich, w tym Doriom, Spinolom i Balbim. W XVII wieku księżna Veronica Spinola sfinansowała renowację kościoła i rozbudowę klasztoru do jego obecnej postaci. Klasztor z czasem przekształcił się w szkołę publiczną o profilu filozoficzno-teologiczno-literackim.
14 maja 1930 roku papież Pius XI nadał kościołowi tytuł bazyliki mniejszej.