2R Dacia Kiszyniów 0–3 0–2 0–5 2004/05 Puchar UEFA 1Q Birkirkara 4–2 1–2 5–4 2Q Bene Sachnin 1–3 0–3 1–6 2006 Puchar Intertoto 1R Ethnikos Achna 2–1 2–4 4–5 2008/09 Puchar UEFA 1Q Široki Brijeg 1–3 0–0 1–3 2015/16 Liga Europy 1Q Strømsgodset IF 0–1 1–3 1–4 2016/17 Liga Europy 1Q Slovan Bratysława 0–0 Slovan Bratysława awansował do II rundy kwalifikacji, ponieważ Partizani zajęło zwolnione miejsce w Lidze Mistrzów. 2016/17 Liga Mistrzów 2QPartizani zajęło miejsce w Lidze Mistrzów po wykluczeniu z rozgrywek mistrza Albanii Skënderbeu Korcza. Ferencváros 1–1 1–1 2–2, k: 3–1 3Q Red Bull Salzburg 0–1 0–2 0–3 2016/17 Liga Europy PO FK Krasnodar 0–0 0–4 0–4 2017/18 Liga Europy 1Q Botew Płowdiw 1–3 0–1 1–4 2018/19 Liga Europy 1Q Maribor 0–1 0–2 0–3 2019/20 Liga Mistrzów 1Q Qarabağ Ağdam 0–0 0–2 0–2 Liga Europy 2Q Sheriff Tyraspol 0–1 1–1 1–2
2021– Sezon Rozgrywki Runda Klub Dom Wyjazd Ogólnie 2021/22 Liga Konferencji Europy 1Q Sfîntul Gheorghe 5–2 3–2 8–4 2Q FC Basel 0–2 0–3 0–5 2022/23 Liga Konferencji Europy 1Q Saburtalo Tbilisi 0–1 1–0 1–1, k: 4–5 2023/24 Liga