Odświeżona została czołówka serialu, w tym aranżacja utworu tytułowego, do którego obok elementów instrumentalnych dodano sopranową wokalizę. Oprócz wymienianych wcześniej Williama Shatnera i Leonarda Nimoya, odtąd w czołówce pojawiały się nazwiska również Gene’a Roddenberry’ego (jako twórcy serialu) oraz DeForesta Kelly’ego (jako trzeciej gwiazdy aktorskiej). Wprowadzono też zasadę, iż nazwiska scenarzystów i reżysera odcinka pojawiają się na ekranie tuż po czołówce, a nie (jak w pierwszym sezonie) dopiero na końcu odcinka. Do stałej obsady dołączył Walter Koenig jako chorąży Chekov.
Sezon 3. W trzecim sezonie całkowity budżet przeznaczony na produkcję jednego odcinka uległ zmniejszeniu, przy jednoczesnej podwyżce płac głównej obsady. Sprawiło to, iż znacznie ograniczone musiały zostać wydatki na scenografię, efekty specjalne, zdjęcia plenerowe czy gaże aktorów występujących gościnnie oraz statystów. Doszło także do zasadniczych zmian w gronie producentów, reżyserów i scenarzystów serialu. Wszystko to doprowadziło do wyraźnego obniżenia jakości technicznej