Struktura komisji wyróżnia komitety, biura podlegające bezpośrednio komisji (Commission Staff Offices, CSO), biura podlegające dyrektorowi wykonawczemu ( Executive Director for Operations, EDO) i stanowisko inspektora generalnego: Komitet doradczy ds. bezpieczeństwa reaktorów jądrowych (Advisory Committee on Reactor Safeguards, ACRS) Komitet doradczy ds. medycznego wykorzystania izotopów (Advisory Committee on the Medical Uses of Isotopes, ACMUI) Rada bezpieczeństwa atomowego i licencjonowania (Atomic Safety and Licensing Board Panel, ASLBP) Biuro Inspektora Generalnego (Office of the Inspector General, OIG) Biura CSO: Biuro Komisji Apelacyjnej (Office of Commission Appellate Adjudication, CAA) Biuro Spraw Kongresu (Office of Congressional Affairs, CA) Biuro Radcy Prawnego (Office of the General Counsel, OGC) Biuro Programów Międzynarodowych (Office of International Programs, IP) Biuro Spraw Publicznych (Office of Public Affairs, PA) Biuro Sekretarza (Office of the Secretary, SECY) Biuro Dyrektora Finansowego (Office of the Chief Financial Officer, CFO) Biuro Dyrektora Wykonawczego (Office of the Executive Director for Operations, EDO): Biuro ds. Nowych Reaktorów (Office of New Reactors, NRO) Biuro ds.