film, pokazywany na 16 festiwalach, uhonorowano licznymi nominacjami i nagrodami The New York Times. Lonergan współpracował również ze Scorsese przy Gangach Nowego Jorku (2002), będąc współautorem scenariusza do tego filmu.
W 2005 ponownie wystąpił w podwójnej roli scenarzysty i reżysera filmu Margaret, z udziałem Anny Paquin, Matta Damona, Matthew Brodericka i J. Smith-Cameron. Film spędził w postprodukcji pięć lat i wszedł na ekrany dopiero w 2011.
Manchester by the Sea, napisany i wyreżyserowany przez Lonergana w 2016, spotkał się z ciepłym przyjęciem i otrzymał 107 nagród i 227 nominacji, w tym prawie 60 honorujących bezpośrednio Kennetha Lonergana za najlepszy scenariusz lub reżyserię, włącznie z nagrodą BAFTA 2017BAFTA 2017 – lista laureatów i Oscarem 2017 za najlepszy scenariusz oryginalny.
Lonergan jest też autorem scenariusza do powstającego 4-odcinkowego miniserialu Howards End. Serial będzie nadawany przez BBC One (w Wielkiej Brytanii) i przez Starz (w Stanach Zjednoczonych).