W 1947 roku, pro-niepodległościowe skrzydło odłączyło się od Masyumi, zakładając ponownie organizację pod nazwą Partai Sarekat Islam Indonesia, odwołującej się do dorobku swojej politycznej poprzedniczkiM.C. Ricklefs, A history of modern Indonesia since c.1200, Stanford 1991, str. 196..
Po uzyskaniu niepodległości Wraz z uzyskaniem niepodległości przez Indonezję, cześć członków ugrupowania znalazła się w pierwszym rządzie Sukarno. W wyborach parlamentarnych w 1955 roku, PSII uzyskała 2,9% głosów, zdobywając tym samym 8 miejsc w Ludowej Izbie ReprezentantówP.H.H. Simanjuntak, Kabinet-Kabinet Republik Indonesia: Dari Awal Kemerdekaan Sampai Reformasi (Cabinets of the Republic of Indonesia: From the Start of Independence to the Reform era, Penerbit Djambatan, Dżakarta 2003..
Po objęciu dyktatorskiej władzy przez Suharto, ugrupowanie wzięło udział w fasadowych wyborach parlamentanych w 1971 roku w których uzyskało 10 miejscH. Feith, The Decline of Constitutional Democracy in Indonesia Equinox Publishing, Singapur 2009, str. 434.. Niecałe