Do harcerstwa – do 15 Łódzkiej Żeńskiej Drużyny Harcerek im. „Zośki” (tzw. Małej Piętnastki) – wstąpiła w 1946 roku. Przyrzeczenie harcerskie złożyła 21 czerwca 1947 roku. Była zastępową oraz przyboczną. Przygotowywała się do funkcji drużynowej.
Zginęła w katastrofie na jeziorze Gardno 18 lipca 1948 roku podczas obozu drużyny harcerskiej. Pochowana 21 lipca 1948 roku w gronie współofiar w części katolickiej Starego Cmentarza w Łodzi.
Od lat 70. XX w. krążyły pogłoski o rozpoczęciu w Archidiecezji Łódzkiej procesu beatyfikacyjnego Joanny Skwarczyńskiej. W ramach 70. rocznicy tragedii na jeziorze Gardno, instruktorzy Chorągwi Łódzkiej ZHP oraz kanclerz archidiecezji, ks. dr Zbigniew Tracz, zdementowali przekazywaną od wielu lat pogłoskę.
Joanna Skwarczyńska była pierwowzorem literackim dla postaci Joanny Stawskiej w książce Jacka Koprowicza pt. „Otchłań”.
Upamiętnienie mały|Pomnik w Gardnie Wielkiej (lipiec 2010) Imię Joanny Skwarczyńskiej noszą drużyny harcerskie w Brzezinach, Łodzi, Radomsku, Bydgoszczy, Gdańsku, Koszalinie, Opolu, Zawadzkiem, Warszawie i Gdyni. 18 października 2003 imię Joanny Skwarczyńskiej nadano Szkole Podstawowej w Gardnie Wielkiej – szkołę zlikwidowano w 2017.
Uwagi
Przypisy