W 1941 roku powróciła do Nicei, gdzie rozpoczęła pracę nad cyklem autobiograficznych obrazów Życie? Czy teatr?. Wykonała ponad tysiąc gwaszy; do scen opowiadających jej życie oraz wydarzenia z życia w okupowanej Francji dodawała podpisy oraz notatki na temat odpowiedniej muzyki mającej nadać odpowiednią oprawę i dramatyzm. W 1943 roku wyszła za mąż za innego żydowskiego uchodźcę, Alexandera Naglera. W obawie przed hitlerowcami swoje prace przekazała zaufanym przyjaciołom. W październiku 1943 roku została schwytana przez Niemców i wywieziona do Auschwitz-Birkenau. Była w piątym miesiącu ciąży. 10 października 1943 roku zginęła w komorze gazowejMartin Gilbert, Atlas historii holocaustu, wyd. Platan, 2000, , str 11.
Twórczość Obrazy Charlotte Salomon tworzące cykl Życie? Czy teatr? po raz pierwszy były wystawiane w latach 60.; pierwszy album z reprodukcjami 80 obrazów Charlotte: pamiętnik w obrazach został wydany w 1963 roku. W 1971 roku kolekcja jej dzieł została umieszczona w Joods Historisch Museum w Amsterdamie. W 1981 roku muzeum zaprezentowało 250 obrazów w kolejności narracji;