Pod koniec lat 30. opublikował prace, w których poddał krytyce bolszewizm i nazistowski rasizm. Z tego powodu musiał się ukrywać w czasie wojny przed gestapo, zaś z bibliotek Niemcy usuwali jego książkiA. Szymaniak, Pastuszka Józef, [w:] Encyklopedia Filozofii Polskiej, t. 2, Lublin 2011, ss. 304-305.O. Ostaszewska, K. Ostaszewski, Środowisko Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego wobec totalitaryzmów 1918–1989, „Studia nad Faszyzmem i Zbrodniami Hitlerowskimi”, 33, 2011, s. 516.R. Śliwiński, Ks. prof. dr Józef Pastuszka – uczony i wychowawca, „Studia Philosophiae Christianae”, 6, 1970, 2, s. 285.H. Szumił, Związki ks. Józefa Pastuszki z Akademią Duchowną w Petersburgu i Katolickim Uniwersytetem Lubelskim, „Studia Sandomierskie”, 26, 2019, s. 123.M. Musielak, Polska międzywojenna myśl polityczna i społeczna wobec rasizmu i higieny rasowej w Trzeciej Rzeszy, „Studia nad Faszyzmem i Zbrodniami Hitlerowskimi”, 31, 2009, ss. 263-264.A. Biela, Nieznane karty z historii psychologii Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego, „Przegląd Psychologiczny”, 53, 2010, nr 3, s. 310..
W 1985 został laureatem Nagrody im.