Gilles
2) Wielki Przeorat Toulouse
3) Wielki Przeorat Owernii
4) Wielki Przeorat Francji
5) Wielki Przeorat Akwitanii
6) Wielki Przeorat Szampanii
Podział Langue Anglii 1) Wielki Przeorat Anglii
2) Wielki Przeorat Szkocji
3) Wielki Przeorat Irlandii
Czasy po reformacji W roku 1798 został ustanowiony Wielki Przeorat Rosji przez cara Pawła I po zajęciu Malty przez Francuzów, inicjując tym samym . Wybór cara Pawła I na Wielkiego Mistrza nie był nigdy ratyfikowany przez rzymskokatolickie prawo kanoniczne, więc był on Wielkim Mistrzem Zakonu de facto, a nie de iure. Przeorat liczył z ilością nie mniej niż sto osiemnaście komandorii.
System komandorii przetrwał do czasów współczesnych, lecz od czasów protestanckiej reformacji zakon został podzielony na cztery zakony sojusznicze:
niemiecki Baliwat Brandenburski brytyjski Najczcigodniejszy Zakon Szpitala Świętego Jana z Jerozolimy szwedzki Johanniterorden i Sverig oraz holenderski Johanniter Orde in Nederland, które tworzą Przymierze Zakonów św. Jana Jerozolimskiego rzymskokatolicki Suwerennego Rycerskiego Zakonu Szpitalników Świętego Jana z Jerozolimy, Rodos i Malty (pot.