początkowo zamierzała dołączyć do nowej formacji tworzonej przez Abdullaha Güla i Recepa Tayyipa Erdoğana. Zrezygnowała jednak z tych planów, po czym przystąpiła do nacjonalistycznej Partii Narodowego Działania (MHP). Lider tej formacji Devlet Bahçeli powołał ją na swojego głównego doradcę do spraw politycznych. W 2002 Meral Akşener znalazła się poza parlamentem. Powróciła do niego jednak w 2007, mandat utrzymywała także w wyniku wyborów z 2011 oraz z czerwca 2015. Pełniła funkcję wiceprzewodniczącej Wielkiego Zgromadzenia Narodowego Turcji.
Nie znalazła się na listach wyborczych MHP w przedterminowych wyborach z listopada 2015. Jej ugrupowanie utraciło wówczas znaczną część głosów, Meral Akşener zażądała wówczas przeprowadzenia nadzwyczajnego kongresu. Ostatecznie w 2016 sama została wykluczona z szeregów partii. W 2017 wzywała do odrzucenia w referendum konstytucyjnym zmian w ustroju państwa promowanych przez środowisko prezydenta Recepa Tayyipa Erdoğana. W październiku tego samego roku ogłosiła powstanie nowej centroprawicowej formacji pod nazwą Dobra Partia, której została przewodniczącą. W czerwcu 2018 kandydowała w wyborach prezydenckich, w pierwszej turze głosowania zajęła 4.