Od zwycięstwa komunistów w chińskiej wojnie domowej w 1949 prefektura apostolska, podobnie jak cały prześladowany Kościół katolicki w Chinach, nie może normalnie działać. W 1958 Patriotyczne Stowarzyszenie Katolików Chińskich mianowało Li Zhenlina swoim ordynariuszem w Lixian, mimo iż prefekt apostolski Hipolito Martínez y Martínez OESA nie zrzekł się tego urzędu. Li Zhenlin rządził prefekturą do śmierci w czasie rewolucji kulturalnej. Kolejnym biskupem PSKCh był Anthony Wang Zicheng (1987 – 1995). W 1999 PSKCh zlikwidowało prefekturę. Zostało to dokonane bez mandatu Stolicy Świętej, więc z kościelnego punktu widzenia działania te były nielegalne.
Brak jest informacji o jakimkolwiek prefekcie apostolskim z Kościoła podziemnego.
Prefekci apostolscy Hipolito Martínez y Martínez OESAHiszpan (1932 - 1963) de facto wydalony z komunistycznych Chin, nie miał po tym czasie realnej władzy w prefekturze sede vacante (być może urząd prefekta sprawowali duchowni Kościoła podziemnego) (1963 - nadal) Methodius Qu Ailin (2012 - nadal) administrator