Sezon 1963/1964 był dla Motoru Lublin 11. sezonem na trzecim szczeblu ligowym. W dwudziestu rozegranych spotkaniach, Motor zdobył 34 punkty i zajął pierwsze miejsce w tabeli. Trenerem zespołu był Leon Kozłowski.
Liga okręgowa Po raz drugi w swojej historii Motor został mistrzem lubelskiej ligi okręgowej, dzięki zwycięstwu 2:0 nad Tomasovią w ostatniej, 22. kolejce i wziął udział w walce o awans do II ligi w grupie barażowej wraz z Warmią Olsztyn, Włókniarzem Łódź, Mazurem Ełk oraz Warszawianką. Na osiem rozegranych spotkań Motor wygrał siedem i jedno zremisował, co dawało drużynie awans na zaplecze ekstraklasy, jednak dwa mecze z Włókniarzem i Warmią zostały zweryfikowane jako walkower dla przeciwników, ze względu na grę nieuprawnionego zawodnika Romana Grudzińskiego. W efekcie Motor zajął drugie miejsce ze stratą jednego punktu do olsztyńskiej Warmii. Po zakończeniu sezonu z funkcji trenera zrezygnował Leon Kozłowski.