Mistrzostwa Afryki U-17 w piłce nożnej 1999 – 3. edycja turnieju o mistrzostwo Afryki w piłce nożnej do lat 17 organizowanego przez CAF, która odbyła się w dniach 16–30 maja 1999 roku. Gospodarzem zostało Mali. Trzy najlepsze reprezentacje awansowały do Mistrzostw Świata U-17 1999 w Nowej Zelandii.
Kwalifikacje Runda wstępna W rundzie wstępnej wzięło udział dziesięć reprezentacji, które zostały podzielone na pięć par. Pierwsze mecze odbyły się w dniach 18–19 lipca, a rewanże 1–2 sierpnia 1998 roku. Zwycięzcy dwumeczów awansowali do pierwszej rundy kwalifikacji. Drużyna 1 Wynik Drużyna 2 1. mecz 2. mecz 1–4 1–1 0–3 4–4 3–0 1–4 wo – – wo – – wo – –
Pierwsza runda W pierwszej rundzie wzięło udział 28 reprezentacji, które zostały podzielone na 14 par. Mecze odbyły się w dniach 20–23 listopada oraz 4–6 grudnia 1998 roku. Zwycięzcy dwumeczów awansowali do drugiej rundy. Drużyna 1 Wynik Drużyna 2 1. mecz 2. mecz 0–6 0–4 0–2 5–1 4–1 1–1 3–1 2–1 1–0 2–4 2–1 0–3 5–2 2–2 3–0 7–3 5–1 2–2 6–1 3–0 3–1 1–0 1–0 0–0 3–2 3–0 0–2 6–1 2–1 4–1 wo 0–1 wo wo – – wo – – wo – –