160 pozycji (w takich czasopismach jak „Ibis”, „Journal of Zoology”, „The Zoologist”, „Natural History Review” i in.).

Spośród licznych prac autorstwa Alfreda Newtona, w tym wielu zdigitalizowanych i dostępnych w Internet Archive, wyróżniana jest przede wszystkim książka The Dictionary of Birds (uznawana za dzieło prawdopodobnie największe). Drugą z jego wielkich prac jest Ootheca Wolleyana – katalog wielkiej kolekcji jaj ptaków, której główną część zgromadził John Wolley. Ojciec zmarłego przyjaciela przekazał, zgodnie z życzeniem syna, jego notatki i zbiory Newtonowi. 24 opakowania (ważące tonę) dostarczono do Elveden w lutym 1860 roku. Po konsultacji z Philipem Sclaterem Newton podjął się opracowania notatek Wolleya – utworzenia katalogu jego bogatej kolekcji. W latach 1864–1907 opublikował cztery tomy Ootheca Wolleyana. Kolejne części, wydawane w latach 1864, 1902, 1905 i 1907, były uzupełniane opisami nowych kolekcji (jaja z Laponii – F.W. i L.M. Knoblock) oraz ilustracjami, wykonanymi przez Henrika Grönvolda (m.in. 8 plansz, ilustrujących wygląd jaj alki olbrzymiej).