Informacje o przebiegu studiów są nieliczne. Wiadomo m.in. że Alfred Newton spotkał w Oksfordzie znanego botanika, prof. , jednak nie skorzystał z tego spotkania, interesując się innymi działami biologii (czego później żałował). Jednym z jego kolegów był Charles Pierrepont Cleaver, z którym m.in. wspólnie malowali okna uczelnianej kaplicy. Od 1854 roku miał tytuł Fellow. Był jednym z pierwszych członków studenckiego klubu o profilu polityczno-społecznym („Klubu Pitta”).
Podróże
W końcowym okresie studiów A. Newton został wyróżniony przyznaniem Travelling Fellowship (inaczej Drury travelling fellowship) – sponsorowanego przez opactwo stypendium, które umożliwiało podróże wybranym synom zasłużonych osób z Norfolku (for a „gentleman’s son of Norfolk’s”)Wieczyste stypendium ufundował w roku 1697 Rev. Drue Drury;