Baraże baraż o III ligę: Jagiellonia Białystok - Sparta Szepietowo baraże o IV ligę: Grom Sobieski Okunin - Skra Drobin 1:0, 3:0 Orkan Sochaczew - Żyrardowianka Żyrardów 2:0, 5:2 Mazovia Mińsk Mazowiecki - Kosovia Kosów Lacki 1:0, 1:2 MKS Przasnysz - Makowianka Maków Mazowiecki 1:2, 1:2 GKS Strzegowo - Powiślanka Lipsko 3:1, 2:4 Rominta Gołdap - Mamry Giżycko 0:0/0:2
1998/1999 gr. 1 Poz.KlubMPkt.BramkiUwagi1Granica Kętrzyn 34 86 87-5 2Legionovia Legionowo 34 75 77-17 3Mazur Karczew 34 62 56-29 do gr. II4Jagiellonia Białystok 34 62 73-39 5ŁKS Łomża 34 56 51-41 6Znicz Pruszków 34 54 62-42 7Warfama-Rolimpex Dobre Miasto 34 52 81-43 do gr. II8Cresovia Pater Siemiatycze 34 49 58-43 9STP Adidas Suwałki 34 48 52-62 10Piast ZAP Piastów 34 47 49-58 11MKS Ciechanów 34 47 70-59 12Huragan Wołomin 34 46 45-45 13Bug Wyszków 34 43 55-56 14MKS Szczytno 34 40 49-59 15Sparta Augustów 34 38 39-68 do gr. II16Orlęta Reszel 34 27 32-62 17Warmia Grajewo 34 20 41-87 18KS Brańszczyk 34 3 15-177 STP Adidas Suwałki został wycofany po sezonie i rozwiązany.